生信防掉坑手册

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面向:易算-华师大-交大生信团队:大家都是生信背景,直接上硬货不需要绕弯子贴名词解释

数据预处理

PCA等可视化

差异比较

要避开的坑:样本分错组;case,control反了;

要明确:差异算法;执行端如何分组;差异筛选的阈值;遇到缺失值是跳过还是填充,还是算作0;差异筛选前后的数量

韦恩分析

要避开的坑:

要明确:

Upset分析

要避开的坑:

要明确:

WGCNA分析

要避开的坑:

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聚类分析

要避开的坑:

要明确:

GSEA分析

要避开的坑:

要明确: