年汇报(刘和斌)

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Liuhebin讨论 | 贡献2024年12月30日 (一) 08:39的版本
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2024年

研发

搜库平台 SearchPlatform

2月:创建平台包含用户登录,搜库,质控功能。以虚拟机形式交付交大的侯老师。

8月:加入多机器的搜索功能(手动),支持搜库进度的查看。

10月:加入队列样本搜库即单独生成psar功能(手动)。

12月:测试比较search with kit 和 merge功能 选择前者。

明年需要增加的功能:改成自动搜库;更新部署流程;与仲达平台对接。 创建缩略图出错:尺寸超过12.5 MP的文件

质谱监控平台 交大转化医学研究院 - OmicsWiki

3月:创建平台包含质谱机时监控与自动质控的功能。

5月:增加轻松连ubibot数据可视化功能。

10月:对接阿里云网盘实现自动上传。

12月:增加删除样本的功能。

明年需要增加的功能:选择日期功能。

Easydia Easydia - OmicsWiki

5月:增加PBMC demo 报告;

6月:更新SN19的数据库;

7月:增加LFQBench Multi-species Spike-in和Injection amount功能;

8月:增加trans_pivot功能;增加EasyPRM功能;

11月:增加IsProteotypic功能;

12月:增加Condiga功能

明年需要增加的功能:更新部署流程;与仲达平台对接。

GlycAP

根据丹丹需求优化了分析周报(何丹丹) - OmicsWiki

6月:定性分析增加统计项目每个样本中不同糖型的占比。

8月:升级功能分析与春玉修改的代码对接。

明年需要增加的功能:增加曹老师文章中的分析。

RAG平台

2月:搭建Academic GPT平台;

7月:建立本地ollama平台。

明年需要增加的功能:提升本地RAG性能,可以接入微信作聊天机器人。

项目

机器学习

YS1155: 从75个蛋白(asepsis_vs_ysepsis)里面,分别把单个蛋白、两个蛋白、三个蛋白组合分类训练和验证AUC达到0.7以上的组合列出来。

pGlycoNovo

糖分析流程2024 - OmicsWiki

(Uncovering missing glycans and unexpected fragments with pGlycoNovo for site-specific glycosylation analysis across species)