年汇报(刘和斌)
2024年
研发
搜库平台 SearchPlatform
2月:创建平台包含用户登录,搜库,质控功能。以虚拟机形式交付交大的侯老师。
8月:加入多机器的搜索功能(手动),支持搜库进度的查看。
10月:加入队列样本搜库即单独生成psar功能(手动)。
12月:测试比较search with kit 和 merge功能 选择前者。
明年需要增加的功能:改成自动搜库;更新部署流程;与仲达平台对接。 创建缩略图出错:尺寸超过12.5 MP的文件
质谱监控平台 交大转化医学研究院 - OmicsWiki
3月:创建平台包含质谱机时监控与自动质控的功能。
5月:增加轻松连ubibot数据可视化功能。
10月:对接阿里云网盘实现自动上传。
12月:增加删除样本的功能。
明年需要增加的功能:选择日期功能。
Easydia Easydia - OmicsWiki
5月:增加PBMC demo 报告;
6月:更新SN19的数据库;
7月:增加LFQBench Multi-species Spike-in和Injection amount功能;
8月:增加trans_pivot功能;增加EasyPRM功能;
11月:增加IsProteotypic功能;
12月:增加Condiga功能
明年需要增加的功能:更新部署流程;与仲达平台对接。
GlycAP
根据丹丹需求优化了分析周报(何丹丹) - OmicsWiki
6月:定性分析增加统计项目每个样本中不同糖型的占比。
8月:升级功能分析与春玉修改的代码对接。
明年需要增加的功能:增加曹老师文章中的分析。
RAG平台
2月:搭建Academic GPT平台;
7月:建立本地ollama平台。
明年需要增加的功能:提升本地RAG性能,可以接入微信作聊天机器人。
项目
机器学习
YS1155: 从75个蛋白(asepsis_vs_ysepsis)里面,分别把单个蛋白、两个蛋白、三个蛋白组合分类训练和验证AUC达到0.7以上的组合列出来。
pGlycoNovo
(Uncovering missing glycans and unexpected fragments with pGlycoNovo for site-specific glycosylation analysis across species)