糖分析流程2024

项目安排

任务安排时间	预计交付时间	实际交付时间	天数	预计耗时	实际耗时	分析项目	详细内容	备注
2023年01月04日(第1周)	2023年01月05日(第1周)	2023年01月05日(第1周)	2	6h	6h	Fig2	pGlycoNovo单独鉴定的230个位点特异性糖了，肽段序列部分参考这个画，把位点match上去，每个位点那里糖组成按照2e那样画。	出图结果：文件:Fig2c.pGlycoNovo.pdf
2023年01月15日(第3周)	2023年01月15日(第3周)	2023年01月15日(第3周)	0	0.5h	0.5h	Fig1	修改Fig1d的文字，坐标轴
2023年03月06日(第10周)	2023年03月11日(第11周)	2023年03月11日(第11周)	2	4h	4h	孔思远糖肽项目	Proteins Intensity Distribution CC type 排序图补充O糖和全部蛋白
2023年04月02日(第14周)	2023年04月09日(第15周)	2023年04月12日(第15周)	4+1	16h	16+4h	Revise	要求： Fig2b中Scan在pGlycoNovo和pGlyco3的交集中相同glycan和不同的比例； Fig2c中230 pGlycNovo的glycans转化成Fig 2d； Data20中谱图一致与谱图+糖型一致的比例，每个物种的谱图交盖； Fig3e中pGlyco-only制作成Fig3f,3g,4a-f(不要底下热图)；	修改完善： 增加对应Fig2的scan交盖表格； 增加Data-20糖型一致列的表格；
2023年04月15日(第16周)	2023年04月19日(第16周)	2023年04月19日(第16周)	4	16h	16h	Revise	要求： Data20中谱图一致性数据表格整合3.revise_fig3b_spectra_overlap_bar.pdf里； Fig3e中pGlyco-only制作成Fig3f,3g,4a-f组合(也要底下热图)； Fig3e中pGlyco3-only+overlap制作成Fig3f,3g,4a-f组合(也要底下热图)；	进行核对
2023年04月29日(第18周)	2023年04月29日(第18周)	2023年04月29日(第18周)	1	2h	2h	Revise	要求： 统计pGlycanFinder的搜库结果Site-Gly去匹配Insect_S_trypsin_after_enrichme…teomics-R1-Compare-SiteGly.xlsx
2023年05月01日(第18周)	2023年05月06日(第19周)	2023年05月06日(第19周)	1	1h	1h	Revise	要求： glycanFinder新添加的没分类的那些，在这个“classified-DB”就写Yes
2023年05月06日(第19周)	2023年05月08日(第19周)	2023年05月09日(第19周)	2	4h	4h	Revise	要求： 加入glycoFinder重绘fig2a
2023年05月29日(第22周)	2023年05月30日(第22周)	2023年05月30日(第22周)	1+1	4h	4+2h	Revise	要求： 把pGlycoNovo单独鉴定到的这230个糖肽，和byonic鉴定到的糖肽，按照：1）Distribution of singly and multiply glycosylated protein（一个蛋白上位点数目分布），2）Distribution of  the number of glycans at each site （一个位点上糖链数目统计），3）Distribution of glycan size（糖链单糖个数统计）。统计规则参照fig4a-c。 图按照统计的这三个统计生产三幅图，每副图都是条形图，每副图上有pGlycoNovo only，Byonic 两类，即2个条形。	修改完善： 增加pGlycoNovo的结果
2023年05月31日(第22周)	2023年05月31日(第22周)	2023年05月31日(第22周)	1+1	4h	4h+2h	Revise	加入Glyco-Decipher 搜库结果重绘revise fig2a	修改完善： 删除16条N=1的糖肽重新绘制
2023年06月07日(第23周)	2023年06月07日(第23周)	2023年06月07日(第23周)	1	2h	2h	Revise	补充pGlycanFinder的验证结果； 补充pGlycanFinder和Glyco-Decipher的site-glycan sheet