任务安排时间
预计交付时间
实际交付时间
天数
预计耗时
实际耗时
分析项目
详细内容
备注
2023年01月04日(第1周)
2023年01月05日(第1周)
2023年01月05日(第1周)
2
6h
6h
Fig2
pGlycoNovo单独鉴定的230个位点特异性糖了,肽段序列部分参考这个画,把位点match上去,每个位点那里糖组成按照2e那样画。
出图结果:文件:Fig2c.pGlycoNovo.pdf
2023年01月15日(第3周)
2023年01月15日(第3周)
2023年01月15日(第3周)
0
0.5h
0.5h
Fig1
修改Fig1d的文字,坐标轴
2023年03月06日(第10周)
2023年03月11日(第11周)
2023年03月11日(第11周)
2
4h
4h
孔思远糖肽项目
Proteins Intensity Distribution CC type 排序图补充O糖和全部蛋白
2023年04月02日(第14周)
2023年04月09日(第15周)
2023年04月12日(第15周)
4+1
16h
16+4h
Revise
要求:
Fig2b中Scan在pGlycoNovo和pGlyco3的交集中相同glycan和不同的比例;
Fig2c中230 pGlycNovo的glycans转化成Fig 2d;
Data20中谱图一致与谱图+糖型一致的比例,每个物种的谱图交盖;
Fig3e中pGlyco-only制作成Fig3f,3g,4a-f(不要底下热图);
修改完善:
增加对应Fig2的scan交盖表格;
增加Data-20糖型一致列的表格;
2023年04月15日(第16周)
2023年04月19日(第16周)
2023年04月19日(第16周)
4
16h
16h
Revise
要求:
Data20中谱图一致性数据表格整合3.revise_fig3b_spectra_overlap_bar.pdf里;
Fig3e中pGlyco-only制作成Fig3f,3g,4a-f组合(也要底下热图);
Fig3e中pGlyco3-only+overlap制作成Fig3f,3g,4a-f组合(也要底下热图);
进行核对
2023年04月29日(第18周)
2023年04月29日(第18周)
2023年04月29日(第18周)
1
2h
2h
Revise
要求:
统计pGlycanFinder的搜库结果Site-Gly去匹配Insect_S_trypsin_after_enrichme…teomics-R1-Compare-SiteGly.xlsx
2023年05月01日(第18周)
2023年05月06日(第19周)
2023年05月06日(第19周)
1
1h
1h
Revise
要求:
glycanFinder新添加的没分类的那些,在这个“classified-DB”就写Yes
2023年05月06日(第19周)
2023年05月08日(第19周)
2023年05月09日(第19周)
2
4h
4h
Revise
要求:
2023年05月29日(第22周)
2023年05月30日(第22周)
2023年05月30日(第22周)
1+1
4h
4+2h
Revise
要求:
把pGlycoNovo单独鉴定到的这230个糖肽,和byonic鉴定到的糖肽,按照:1)Distribution of singly and multiply glycosylated protein(一个蛋白上位点数目分布),2)Distribution of the number of glycans at each site (一个位点上糖链数目统计),3)Distribution of glycan size(糖链单糖个数统计)。统计规则参照fig4a-c。 图按照统计的这三个统计生产三幅图,每副图都是条形图,每副图上有pGlycoNovo only,Byonic 两类,即2个条形。
修改完善:
2023年05月31日(第22周)
2023年05月31日(第22周)
2023年05月31日(第22周)
1+1
4h
4h+2h
Revise
加入Glyco-Decipher 搜库结果重绘revise fig2a
修改完善: