糖分析流程2024

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Liuhebin讨论 | 贡献2024年4月29日 (一) 10:21的版本
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项目安排
任务安排时间 预计交付时间 实际交付时间 天数 预计耗时 实际耗时 分析项目 详细内容 备注
2023年01月04日(第1周) 2023年01月05日(第1周) 2023年01月05日(第1周) 2 6h 6h Fig2 pGlycoNovo单独鉴定的230个位点特异性糖了,肽段序列部分参考这个画,把位点match上去,每个位点那里糖组成按照2e那样画。
出图结果:文件:Fig2c.pGlycoNovo.pdf
2023年01月15日(第3周) 2023年01月15日(第3周) 2023年01月15日(第3周) 0 0.5h 0.5h Fig1 修改Fig1d的文字,坐标轴
2023年03月06日(第10周) 2023年03月11日(第11周) 2023年03月11日(第11周) 2 4h 4h 孔思远糖肽项目 Proteins Intensity Distribution CC type 排序图补充O糖和全部蛋白
2023年04月02日(第14周) 2023年04月09日(第15周) 2023年04月12日(第15周) 4+1 16h 16+4h Revise 要求:
  • Fig2b中Scan在pGlycoNovo和pGlyco3的交集中相同glycan和不同的比例;
  • Fig2c中230 pGlycNovo的glycans转化成Fig 2d;
  • Data20中谱图一致与谱图+糖型一致的比例,每个物种的谱图交盖;
  • Fig3e中pGlyco-only制作成Fig3f,3g,4a-f(不要底下热图);
修改完善:
  • 增加对应Fig2的scan交盖表格;
  • 增加Data-20糖型一致列的表格;
2023年04月15日(第16周) 2023年04月19日(第16周) 2023年04月19日(第16周) 4 16h 16h Revise 要求:
  • Data20中谱图一致性数据表格整合3.revise_fig3b_spectra_overlap_bar.pdf里;
  • Fig3e中pGlyco-only制作成Fig3f,3g,4a-f组合(也要底下热图);
  • Fig3e中pGlyco3-only+overlap制作成Fig3f,3g,4a-f组合(也要底下热图);
进行核对
2023年04月29日(第18周) 2023年04月29日(第18周) 2023年04月29日(第18周) 1 2h 2h Revise 要求:
  • 统计pGlycanFinder的搜库结果Site-Gly去匹配Insect_S_trypsin_after_enrichme…teomics-R1-Compare-SiteGly.xlsx