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Yugan讨论 | 贡献2024年4月1日 (一) 07:15的版本 →‎设计流程图
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项目流程汇总

发生时间 交付时间 类型 详细内容 备注
2023年12月26日(第52周) 2024年01月22日(第04周) 搜库平台 编辑condition table实现自动化改replicate;

condition table color列显示颜色加可选

2024年01月04日(第01周) 2024年01月04日(第01周) 目录建立问题,目录名称出现空格后进行报错提醒
2024年01月08日(第02周) 2024年01月26日(第04周) 用户手册 构建网站pdf
2024年01月26日(第04周) 2024年01月29日(第05周) 测试交付 bug修复:
  • 修复质控时文件名重复会报错的问题;

bug发现:

  • 发现选择hybrid时还是进行directDIA的问题;
2024年01月29日(第05周) 2024年02月01日(第05周) 测试per run功能 功能更新:
  • 含空值的文件夹不显示(会影响搜库和QC);
  • 若文件夹中没有原始文件则不显示condition表格;
  • 优化表格(蛋白/肽段)对于长文本的显示问题;
  • 增加检测相同project name则不能进行搜库的功能;bug修复:
  • 修复选择condition或hybrid时不会进入相应搜索的问题;
  • 修复因虚拟机不能联网而造成的无法发邮件的问题;
  • 修复condition表格会显示per run结果的问题;
2024年01月29日(第05周) 2024年02月01日(第05周) 添加定量表格输出和批量下载功能
2024年01月31日(第05周) 2024年02月01日(第05周) 邮件中增加提醒地址
2024年01月29日(第05周) 建库功能
2024年01月29日(第05周) 版本更迭与仲达对接 2024.02.04:手动代码覆盖;
2024年01月29日(第05周) diann time-series qc 功能
2024年01月29日(第05周) 2024年02月20日(第08周) 增加用户登录系统 功能更新:
  • 修复有相同文件名时不弹窗的bug;
  • 增加Report rmd的雷达图介绍;
2024年02月19日(第08周) 2024年02月23日(第08周) 侯老师分测中心培训 功能更新:
  • 增加管理员proteinGroup和custom;
2024年02月19日(第08周) 生信分析
2024年02月26日(第09周) 优化报告的导航 功能更新:
  • 提交任务界面的分组表格可以选择;
  • 修改未成功搜库导致的发错邮件的bug;
2024年01月04日(第01周) 自动化出报告 拆分定量结果文件并出word报告 对接何丹丹
2024年01月04日(第01周) 增加建库功能 对接何丹丹

设计流程图

搜库平台功能

  • 选择目标原始文件所在文件夹进行搜库;
  • 可自定义搜索参数和导出文件格式的参数;
  • 可选择不同类型包含directDIA,hybrid-DIA等搜索方式;
  • 可进行Condition编辑(亦方便后续接生信);
  • 有搜库完和QC完的邮件提醒;
  • 实时查看搜索Log进度;
  • 实时查看QC报告(后续可接生信报告);
  • QC完后如需定量进行定量流程;
  • 查看定量报告和下载结果;

QC 功能

目前分为LC,MS,Identification,Quantification,雷达部分

LC

MS1/MS2 TIC

RT Fragment/Precursor Distribution

Delta RT

FWHM Distribution

Data points per peak

Capacity

MS

MS1/MS2 Mass Accrarcy

Identification

Experiment identification Frequence

Missed Cleavages

Charge

Quantification

Heatmap

Normalized Quantity Distribution

Quantity CV

Correlation

PCA

Radar

Quantitative stability

RT stability

Peak width

DPPP

MS1/MS2 mass accuracy

Missed cleavage